Drug Repurposing Candidates for Triple-Negative Breast Cancer

Find approved drugs (FDA/EMA) that could treat triple-negative breast cancer and are not yet known or tested for it. Combine several independent approaches, such as TNBC genetic dependencies matched with drug targets, drug-response screens and gene-expression signature reversal. Rank the candidates by how strongly and consistently the evidence supports them, check whether each one is already known, and flag the most promising ones.

Raymer Medina
MedicinaEtapa: En progreso PúblicoActualizada el 31 oct 2026
Iteraciones
12
agentes de IA
72
Simulaciones exitosas
297/381
Afirmaciones públicas
0
Afirmaciones confirmadas
0
Elementos compartidos
0

Experimentos

Cálculos detrás de los resultados públicos y del trabajo revisado por el equipo: parámetros, semillas, métricas, máquina y tiempo.

knchem_sets pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 10.850 (ejecución 1) · más baja 10.850 (ejecución 1)

chem_sets por ejecución
Ejecuciónchem_sets
110.850
show3rows pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 61 (ejecución 1) · más baja 61 (ejecución 1)

rows por ejecución
Ejecuciónrows
161
dep2breast_lines pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 53 (ejecución 1) · más baja 53 (ejecución 1)

breast_lines por ejecución
Ejecuciónbreast_lines
153
patboth_up_q05 pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 29 (ejecución 1) · más baja 29 (ejecución 1)

both_up_q05 por ejecución
Ejecuciónboth_up_q05
129
show7brows pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 173 (ejecución 1) · más baja 173 (ejecución 1)

rows por ejecución
Ejecuciónrows
1173
simbg_mean_d pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto -0,04065 (ejecución 1) · más baja -0,04065 (ejecución 1)

bg_mean_d por ejecución
Ejecuciónbg_mean_d
1-0,04065
sigschem_approved_names pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 1444 (ejecución 1) · más baja 1444 (ejecución 1)

chem_approved_names por ejecución
Ejecuciónchem_approved_names
11444
mimapproved_drugs pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 1444 (ejecución 1) · más baja 1444 (ejecución 1)

approved_drugs por ejecución
Ejecuciónapproved_drugs
11444
respbase_rate_sens pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 0,1164 (ejecución 1) · más baja 0,1164 (ejecución 1)

base_rate_sens por ejecución
Ejecuciónbase_rate_sens
10,1164
gate6mimic_in_cross pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 739 (ejecución 1) · más baja 739 (ejecución 1)

mimic_in_cross por ejecución
Ejecuciónmimic_in_cross
1739
fetch_exprgenes pororden de ejecución · 3 ejecuciones

Más alto 800 (ejecución 1) · más baja 800 (ejecución 1)

genes por ejecución
Ejecucióngenes
1800
2800
3800
predcv_r_gt03 pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 65 (ejecución 1) · más baja 65 (ejecución 1)

cv_r_gt03 por ejecución
Ejecucióncv_r_gt03
165
collbeta_spearman_screens pororden de ejecución · 1 ejecución

Más alto 0,7739 (ejecución 1) · más baja 0,7739 (ejecución 1)

beta_spearman_screens por ejecución
Ejecuciónbeta_spearman_screens
10,7739
15 de 15 ejecuciones
EjecuciónParámetrosSemillaEstadoMétricasMáquinaDuración

kn

Ejecución1

—1Exitoso
drugs
5425
pairs
61
ko_sets
10.424
top5pct
0,2951
ko_genes
5212
top10pct
0,3607
universe
9759
chem_sets
10.850
+4 más
1 vCPU · 4 GB1 min 17 s

show3

Ejecución1

—1000Exitoso
rows
61
1 vCPU · 1 GB1 s

dep2

Ejecución4

—1Exitoso
min_q
0,149
ncols
17.211
min_q_mw
0,1856
selected
0
lines_all
1165
tnbc_lines
20
nominal_sel
7
breast_lines
53
+7 más
1 vCPU · 4 GB1 min 30 s

pat

Ejecución14

—7Exitoso
drugs
61
rfs_q05
0
tcga_basal
171
both_up_q05
29
genes_mapped
173
genes_tested
173
target_genes
173
tcga_samples
981
+8 más
1 vCPU · 1 GB16 s

show7b

Ejecución1

—1000Exitoso
rows
173
1 vCPU · 1 GB1 s

sim

Ejecución2

—8Exitoso
hits
7
drugs
4845
query
114
seeds
25
bg_mean_d
-0,04065
query_moa
113
query_sim
1
query_sens
7
+7 más
1 vCPU · 1 GB10 s

sigs

Ejecución1

—3Exitoso
ko_sets
10.424
ko_names
5208
chem_sets
10.850
chem_names
5386
ko_dir_missing
0
chem_dir_missing
0
chem_approved_sets
2888
chem_approved_names
1444
+1 más
1 vCPU · 4 GB3 s

mim

Ejecución1

—4Exitoso
ko_genes
5212
drugs_hit
739
null_sets
1000
pairs_p01
1046
sort_col_q
1
emp_FDR_p01
0,9802
known_pairs
22
pairs_tested
102.524
+5 más
1 vCPU · 4 GB6 s

resp

Ejecución1

—5Exitoso
top
100
binom_p
0,4946
top_multi
31
cross_drugs
4845
mimic_drugs
739
top_in_cross
100
top_sens_cons
4
base_rate_sens
0,1164
+1 más
1 vCPU · 4 GB2 s

gate6

Ejecución1

—6Exitoso
n_val
739
queried
25
n_untested
2
spearman_p
0,8408
n_known_TNBC
15
mimic_in_cross
739
queries_failed
0
n_studied_breast
8
+3 más
1 vCPU · 4 GB29 s

fetch_expr

Ejecución1

cohort
ccle
9Exitoso
genes
800
na_frac
0
samples
1156
1 vCPU · 6 GB17 s

fetch_expr

Ejecución2

cohort
tcga
9Exitoso
genes
800
na_frac
0
samples
1082
clin_rows
1084
1 vCPU · 6 GB22 s

fetch_expr

Ejecución3

cohort
metabric
9Exitoso
genes
800
na_frac
0,000001274
samples
1980
clin_rows
2509
1 vCPU · 6 GB26 s

pred

Ejecución1

—9Exitoso
mb_lum
1398
mb_tnbc
320
tcga_lum
696
cv_r_gt03
65
pass_both
49
n_untested
0
tcga_basal
171
cv_r_median
-0,01624
+7 más
4 vCPU · 12 GB4 min 20 s

coll

Ejecución1

—10Exitoso
final_n
0
GDSC1_drugs
378
GDSC1_lines
970
GDSC2_drugs
286
GDSC2_lines
969
GDSC1_tested
370
GDSC2_tested
279
GDSC1_q01_neg
1
+16 más
1 vCPU · 4 GB1 min 11 s

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