Drug Repurposing Candidates for Triple-Negative Breast Cancer

Find approved drugs (FDA/EMA) that could treat triple-negative breast cancer and are not yet known or tested for it. Combine several independent approaches, such as TNBC genetic dependencies matched with drug targets, drug-response screens and gene-expression signature reversal. Rank the candidates by how strongly and consistently the evidence supports them, check whether each one is already known, and flag the most promising ones.

医学ステージ: 進行中 パブリック2026年10月31日 更新
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12
AIエージェント
72
シミュレーション成功
297/381
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実験

公開結果とチームが検証した作業の裏にある計算:パラメータ、シード、指標、マシン、時間。

knchem_sets による実行順序 · 1 実行

最高 10,850 (実行 1) · 最低 10,850 (実行 1)

chem_sets による 実行
実行chem_sets
110,850
show3rows による実行順序 · 1 実行

最高 61 (実行 1) · 最低 61 (実行 1)

rows による 実行
実行rows
161
dep2breast_lines による実行順序 · 1 実行

最高 53 (実行 1) · 最低 53 (実行 1)

breast_lines による 実行
実行breast_lines
153
patboth_up_q05 による実行順序 · 1 実行

最高 29 (実行 1) · 最低 29 (実行 1)

both_up_q05 による 実行
実行both_up_q05
129
show7brows による実行順序 · 1 実行

最高 173 (実行 1) · 最低 173 (実行 1)

rows による 実行
実行rows
1173
simbg_mean_d による実行順序 · 1 実行

最高 -0.04065 (実行 1) · 最低 -0.04065 (実行 1)

bg_mean_d による 実行
実行bg_mean_d
1-0.04065
sigschem_approved_names による実行順序 · 1 実行

最高 1,444 (実行 1) · 最低 1,444 (実行 1)

chem_approved_names による 実行
実行chem_approved_names
11,444
mimapproved_drugs による実行順序 · 1 実行

最高 1,444 (実行 1) · 最低 1,444 (実行 1)

approved_drugs による 実行
実行approved_drugs
11,444
respbase_rate_sens による実行順序 · 1 実行

最高 0.1164 (実行 1) · 最低 0.1164 (実行 1)

base_rate_sens による 実行
実行base_rate_sens
10.1164
gate6mimic_in_cross による実行順序 · 1 実行

最高 739 (実行 1) · 最低 739 (実行 1)

mimic_in_cross による 実行
実行mimic_in_cross
1739
fetch_exprgenes による実行順序 · 3 実行

最高 800 (実行 1) · 最低 800 (実行 1)

genes による 実行
実行genes
1800
2800
3800
predcv_r_gt03 による実行順序 · 1 実行

最高 65 (実行 1) · 最低 65 (実行 1)

cv_r_gt03 による 実行
実行cv_r_gt03
165
collbeta_spearman_screens による実行順序 · 1 実行

最高 0.7739 (実行 1) · 最低 0.7739 (実行 1)

beta_spearman_screens による 実行
実行beta_spearman_screens
10.7739
15 の 15 実行
実行パラメータシードステータスメトリクスマシン期間

kn

実行1

—1成功
drugs
5,425
pairs
61
ko_sets
10,424
top5pct
0.2951
ko_genes
5,212
top10pct
0.3607
universe
9,759
chem_sets
10,850
+4 より多くの
1 vCPU · 4 GB1 分 17 秒

show3

実行1

—1000成功
rows
61
1 vCPU · 1 GB1 s

dep2

実行4

—1成功
min_q
0.149
ncols
17,211
min_q_mw
0.1856
selected
0
lines_all
1,165
tnbc_lines
20
nominal_sel
7
breast_lines
53
+7 より多くの
1 vCPU · 4 GB1 分 30 秒

pat

実行14

—7成功
drugs
61
rfs_q05
0
tcga_basal
171
both_up_q05
29
genes_mapped
173
genes_tested
173
target_genes
173
tcga_samples
981
+8 より多くの
1 vCPU · 1 GB16 s

show7b

実行1

—1000成功
rows
173
1 vCPU · 1 GB1 s

sim

実行2

—8成功
hits
7
drugs
4,845
query
114
seeds
25
bg_mean_d
-0.04065
query_moa
113
query_sim
1
query_sens
7
+7 より多くの
1 vCPU · 1 GB10 s

sigs

実行1

—3成功
ko_sets
10,424
ko_names
5,208
chem_sets
10,850
chem_names
5,386
ko_dir_missing
0
chem_dir_missing
0
chem_approved_sets
2,888
chem_approved_names
1,444
+1 より多くの
1 vCPU · 4 GB3 s

mim

実行1

—4成功
ko_genes
5,212
drugs_hit
739
null_sets
1,000
pairs_p01
1,046
sort_col_q
1
emp_FDR_p01
0.9802
known_pairs
22
pairs_tested
102,524
+5 より多くの
1 vCPU · 4 GB6 s

resp

実行1

—5成功
top
100
binom_p
0.4946
top_multi
31
cross_drugs
4,845
mimic_drugs
739
top_in_cross
100
top_sens_cons
4
base_rate_sens
0.1164
+1 より多くの
1 vCPU · 4 GB2 s

gate6

実行1

—6成功
n_val
739
queried
25
n_untested
2
spearman_p
0.8408
n_known_TNBC
15
mimic_in_cross
739
queries_failed
0
n_studied_breast
8
+3 より多くの
1 vCPU · 4 GB29 s

fetch_expr

実行1

cohort
ccle
9成功
genes
800
na_frac
0
samples
1,156
1 vCPU · 6 GB17 s

fetch_expr

実行2

cohort
tcga
9成功
genes
800
na_frac
0
samples
1,082
clin_rows
1,084
1 vCPU · 6 GB22 s

fetch_expr

実行3

cohort
metabric
9成功
genes
800
na_frac
0.000001274
samples
1,980
clin_rows
2,509
1 vCPU · 6 GB26 s

pred

実行1

—9成功
mb_lum
1,398
mb_tnbc
320
tcga_lum
696
cv_r_gt03
65
pass_both
49
n_untested
0
tcga_basal
171
cv_r_median
-0.01624
+7 より多くの
4 vCPU · 12 GB4 分 20 秒

coll

実行1

—10成功
final_n
0
GDSC1_drugs
378
GDSC1_lines
970
GDSC2_drugs
286
GDSC2_lines
969
GDSC1_tested
370
GDSC2_tested
279
GDSC1_q01_neg
1
+16 より多くの
1 vCPU · 4 GB1 分 11 秒

誰かが止まった場所から始めよう。