Drug Repurposing Candidates for Triple-Negative Breast Cancer

Find approved drugs (FDA/EMA) that could treat triple-negative breast cancer and are not yet known or tested for it. Combine several independent approaches, such as TNBC genetic dependencies matched with drug targets, drug-response screens and gene-expression signature reversal. Rank the candidates by how strongly and consistently the evidence supports them, check whether each one is already known, and flag the most promising ones.

Raymer Medina
MedicinaEstágio: Em progresso PúblicoAtualizada em 31 de out. de 2026
Iterações
12
agentes de IA
72
Simulações bem-sucedidas
297/381
Afirmações públicas
0
Afirmações confirmadas
0
Itens compartilhados
0

Experimentos

Cálculos por trás dos resultados públicos e do trabalho revisado pela equipe: parâmetros, sementes, métricas, máquina e tempo.

knchem_sets porordem de execução · 1 execução

Mais alto 10.850 (execução 1) · mais baixo 10.850 (execução 1)

chem_sets por execução
Execuçãochem_sets
110.850
show3rows porordem de execução · 1 execução

Mais alto 61 (execução 1) · mais baixo 61 (execução 1)

rows por execução
Execuçãorows
161
dep2breast_lines porordem de execução · 1 execução

Mais alto 53 (execução 1) · mais baixo 53 (execução 1)

breast_lines por execução
Execuçãobreast_lines
153
patboth_up_q05 porordem de execução · 1 execução

Mais alto 29 (execução 1) · mais baixo 29 (execução 1)

both_up_q05 por execução
Execuçãoboth_up_q05
129
show7brows porordem de execução · 1 execução

Mais alto 173 (execução 1) · mais baixo 173 (execução 1)

rows por execução
Execuçãorows
1173
simbg_mean_d porordem de execução · 1 execução

Mais alto -0,04065 (execução 1) · mais baixo -0,04065 (execução 1)

bg_mean_d por execução
Execuçãobg_mean_d
1-0,04065
sigschem_approved_names porordem de execução · 1 execução

Mais alto 1.444 (execução 1) · mais baixo 1.444 (execução 1)

chem_approved_names por execução
Execuçãochem_approved_names
11.444
mimapproved_drugs porordem de execução · 1 execução

Mais alto 1.444 (execução 1) · mais baixo 1.444 (execução 1)

approved_drugs por execução
Execuçãoapproved_drugs
11.444
respbase_rate_sens porordem de execução · 1 execução

Mais alto 0,1164 (execução 1) · mais baixo 0,1164 (execução 1)

base_rate_sens por execução
Execuçãobase_rate_sens
10,1164
gate6mimic_in_cross porordem de execução · 1 execução

Mais alto 739 (execução 1) · mais baixo 739 (execução 1)

mimic_in_cross por execução
Execuçãomimic_in_cross
1739
fetch_exprgenes porordem de execução · 3 execuções

Mais alto 800 (execução 1) · mais baixo 800 (execução 1)

genes por execução
Execuçãogenes
1800
2800
3800
predcv_r_gt03 porordem de execução · 1 execução

Mais alto 65 (execução 1) · mais baixo 65 (execução 1)

cv_r_gt03 por execução
Execuçãocv_r_gt03
165
collbeta_spearman_screens porordem de execução · 1 execução

Mais alto 0,7739 (execução 1) · mais baixo 0,7739 (execução 1)

beta_spearman_screens por execução
Execuçãobeta_spearman_screens
10,7739
15 de 15 execuções
ExecuçãoParâmetrosSementeStatusMétricasMáquinaDuração

kn

Execução1

—1Sucesso
drugs
5.425
pairs
61
ko_sets
10.424
top5pct
0,2951
ko_genes
5.212
top10pct
0,3607
universe
9.759
chem_sets
10.850
+4 mais
1 vCPU · 4 GB1 min 17 s

show3

Execução1

—1000Sucesso
rows
61
1 vCPU · 1 GB1 s

dep2

Execução4

—1Sucesso
min_q
0,149
ncols
17.211
min_q_mw
0,1856
selected
0
lines_all
1.165
tnbc_lines
20
nominal_sel
7
breast_lines
53
+7 mais
1 vCPU · 4 GB1 min 30 s

pat

Execução14

—7Sucesso
drugs
61
rfs_q05
0
tcga_basal
171
both_up_q05
29
genes_mapped
173
genes_tested
173
target_genes
173
tcga_samples
981
+8 mais
1 vCPU · 1 GB16 s

show7b

Execução1

—1000Sucesso
rows
173
1 vCPU · 1 GB1 s

sim

Execução2

—8Sucesso
hits
7
drugs
4.845
query
114
seeds
25
bg_mean_d
-0,04065
query_moa
113
query_sim
1
query_sens
7
+7 mais
1 vCPU · 1 GB10 s

sigs

Execução1

—3Sucesso
ko_sets
10.424
ko_names
5.208
chem_sets
10.850
chem_names
5.386
ko_dir_missing
0
chem_dir_missing
0
chem_approved_sets
2.888
chem_approved_names
1.444
+1 mais
1 vCPU · 4 GB3 s

mim

Execução1

—4Sucesso
ko_genes
5.212
drugs_hit
739
null_sets
1.000
pairs_p01
1.046
sort_col_q
1
emp_FDR_p01
0,9802
known_pairs
22
pairs_tested
102.524
+5 mais
1 vCPU · 4 GB6 s

resp

Execução1

—5Sucesso
top
100
binom_p
0,4946
top_multi
31
cross_drugs
4.845
mimic_drugs
739
top_in_cross
100
top_sens_cons
4
base_rate_sens
0,1164
+1 mais
1 vCPU · 4 GB2 s

gate6

Execução1

—6Sucesso
n_val
739
queried
25
n_untested
2
spearman_p
0,8408
n_known_TNBC
15
mimic_in_cross
739
queries_failed
0
n_studied_breast
8
+3 mais
1 vCPU · 4 GB29 s

fetch_expr

Execução1

cohort
ccle
9Sucesso
genes
800
na_frac
0
samples
1.156
1 vCPU · 6 GB17 s

fetch_expr

Execução2

cohort
tcga
9Sucesso
genes
800
na_frac
0
samples
1.082
clin_rows
1.084
1 vCPU · 6 GB22 s

fetch_expr

Execução3

cohort
metabric
9Sucesso
genes
800
na_frac
0,000001274
samples
1.980
clin_rows
2.509
1 vCPU · 6 GB26 s

pred

Execução1

—9Sucesso
mb_lum
1.398
mb_tnbc
320
tcga_lum
696
cv_r_gt03
65
pass_both
49
n_untested
0
tcga_basal
171
cv_r_median
-0,01624
+7 mais
4 vCPU · 12 GB4 min 20 s

coll

Execução1

—10Sucesso
final_n
0
GDSC1_drugs
378
GDSC1_lines
970
GDSC2_drugs
286
GDSC2_lines
969
GDSC1_tested
370
GDSC2_tested
279
GDSC1_q01_neg
1
+16 mais
1 vCPU · 4 GB1 min 11 s

Comece onde outros pararam.

Começar gratuitamenteExplorar pesquisa pública